Trois modes couvrent un large éventail de conditions de conduite, offrant soit des performances accrues en conduite sportive, soit la tranquillité d'esprit dans certaines conditions pour négocier avec confiance les surfaces glissantes.

La Versys 1000 S est équipée d'une selle confort qui possède un rembourrage en uréthane plus épais pour offrir le confort nécessaire pour passer de longues heures au guidon, tout en offrant aux pilotes de grande taille une flexion des genoux détendue. Elle peut également être équipée de l'accessoire selle basse (20 mm plus bas) qui favorise un accès facile au sol.

Les poignées chauffantes offrent un confort accru les jours de grand froid. Ils entourent entièrement les poignées, assurant une excellente chaleur.

Chacun des trois feux possède une orientation fixe et s’allume en fonction de l’angle d’inclinaison. À mesure que la moto se penche, ils s’allument l’un après l’autre afin d’élargir le faisceau lumineux selon la direction de la moto.

Les disques avant en pétales de ø310 mm sont maintenant serrés par des étriers monoblocs très rigides à montage radial, accompagnés d'un maître-cylindre de frein avant à pompe radiale, ce qui contribue à un feeling exceptionnel et à une formidable puissance de freinage.

Avec ce dispositif Kawasaki, le conducteur fixe sa vitesse de croisière d’une simple pression sur un bouton.

La Versys S est équipée de série de modes de conduite intégrés permettant la sélection de trois modes qui combinent automatiquement les réglages du contrôle de traction et de puissance les plus appropriés pour le sport, la route, la pluie et un mode manuel.

Parce que la vraie conduite se fait dans des rues qui sont souvent moins régulières que les circuits, les imperfections de la route (bosses, nids de poule) sont loin d'être rares, et certaines rues ne sont même pas bitumées (pavés, etc.), les ingénieurs de Kawasaki ont choisi une suspension à long débattement pour permettre aux pilotes de prendre les virages avec aisance.

Bien qu'elle n'ait pas été conçue pour une utilisation tout-terrain, la capacité de la suspension à long débattement à s'adapter à des conditions de route moins que parfaites permet à la Versys 1000 de rester stable là où des motos aux réglages plus rigides et plus sportifs nécessiteraient de relâcher l'accélérateur. Les roues légères de 17 pouces à l'avant et à l'arrière contribuent à une tenue de route rapide et sportive.

L'instrumentation couleur TFT compacte et entièrement numérique donne au cockpit un aspect de haute technologie et de qualité. L'écran couleur de haute qualité est doté de la technologie TFT (transistor à couche mince), qui offre un niveau de visibilité élevé. La couleur de fond de l'écran est sélectionnable (noir ou blanc), et la luminosité de l'écran s'ajuste automatiquement en fonction de la lumière disponible. En plus des autres fonctionnalités, deux modes d'affichage offrent aux pilotes le choix de la présentation de leurs informations.

Le dispositif KCMF surveille les paramètres du moteur et de la partie-cycle tout au long du virage (entrée, point de corde, sortie), en modulant la force de freinage et la puissance moteur afin de lisser la transition accélération/freinage, puis la remise des gaz, en aidant ainsi le pilote à suivre parfaitement la trajectoire souhaitée tout au long du virage.

Le KCMF supervise les aides électroniques suivantes (lorsqu'elles sont disponibles) :
- KTRC (Contrôle de Traction Kawasaki)
- KLCM (Mode de départ "Launch Control")
- KIBS (Système intelligent d'antiblocage des roues Kawasaki)
- KEBC (Système de contrôle du frein moteur)

Pour le confort des longs trajets à vitesse soutenue, la hauteur de la bulle est ajustable depuis la selle, en fonction des préférences du pilote.

Grâce à une puce Bluetooth intégrée au tableau de bord, le pilote peut synchroniser un smartphone à la moto sans connexion filaire. Ainsi, certaines fonctions de l'instrumentation sont accessibles via l’application dédiée « RIDEOLOGY THE APP », permettant une expérience de conduite exceptionnelle.

Chacune des nouvelles optiques à LED est équipée de feux de route, de croisement et de position. 

Auparavant proposée en option, une prise 12V est désormais fournie d’origine et dispose d’un pré-câblage. La puissance totale disponible est de 40 W.

Les papillons électroniques permettent à l'ECU de contrôler le volume de carburant (via les injecteurs de carburant) et d'air (via les papillons) délivré au moteur. La position idéale de l'injection de carburant et du papillon des gaz permet d'obtenir une réponse naturelle et en douceur du moteur, ainsi qu'un rendement idéal.

De la double optique de phares restylée au nouveau feu arrière, en passant par les clignotants compacts et la plaque minéralogique, l’intégralité de l’éclairage est à LED.

Pour compléter le caractère exaltant du moteur de la Versys 1000 S, l'équipement de série du modèle comprend quick-shifter qui permet de passer les vitesses supérieures et inférieures sans embrayage pour une accélération en douceur et une décélération rapide et facile.

Réglé pour un usage polyvalent, le quatre cylindres en ligne de 1 043 cm3 assure une réponse instantanée à l’accélération, un couple élevé à tous les régimes (en particulier à bas et moyens régimes) et une belle sonorité à l’admission. L’adoption d’un contrôle électronique d'accélérateur a permis d’ajouter un régulateur de vitesse électronique.

Déjà présent sur les Ninja H2 et Ninja ZX-10R, le freinage antiblocage intelligent KIBS équipe maintenant de série la Versys 1000. Sa programmation et son paramétrage ont été adaptés aux performances d’un trail et au grand débattement des suspensions.

Le système de montage des sacoches permet de les fixer et de les retirer très simplement, ce qui contribue à un confort accru.  Intégrant les sacoches à l'arrière de la moto, le système de montage positionne les sacoches près de l'axe de la moto et, grâce à sa conception qualitative et sans encombrement, garantit que l'arrière conserve un bel aspect lorsque les sacoches sont retirées.