Au lieu d’un système d’injection avec pompe de débit, la KLX125 est équipée d’un système d’injection similaire aux plus grosses cylindrées (et dans lequel pompe à carburant, injecteur et papillon des gaz constituent des éléments séparés). Il permet de réduire les risques d’entrée d’air, le rendant parfait pour la conduite sportive.